由「國家組織CIRS」新設的特殊技能訓練校「美濱學園」……因各種原因失去歸所的少女們被交付的是，槍與實彈。使用手槍的玲奈、擅長狙擊的桐花、炸彈與信息處理的克莉絲、負責諜報活動的忍者邑沙季。她們每天都以SORD成員的身份，處理警察及自衛隊無法解決的事件，不斷進行著危險的活動。
K縣U港——。準備入國的重要人士突然消失了。SORD成員開始調查失蹤事件，但每當即將捕獲消失的「行李」時，就會在還差一點的時候被其逃脫。與姊妹校「京船櫻丘」的SORD成員雙子姐妹並肩作戰，以及爭執。以及——在夜晚的城鎮中疾奔的神秘女騎手「Soul Speed」·真紀的傳聞——。追蹤最終轉變成壯烈的死戰，將身心一並撕裂。
……但這同時還是，通往玲奈她們相遇之前的過去的旅程。
